برگزاری کارگاه سیستم‌بیولوژی و آنالیز داده‌های بیان ژن با GEO- اذر ماه پژوهش 1404

✅ مرکز تحقیقات بیوانفورماتیک: کارگاه آموزشی-پژوهشی تحت عنوان: «سیستم‌بیولوژی و آنالیز داده‌های بیان ژن با GEO»  در تاریخ 25 آذر از ساعت 8 تا 11 در تالار ابوریحان دانشکده داروسازی با سخنرانی جناب آقای دکتر مهدی عضو هیات علمی مرکز تحقیقات بیوانفورماتیک برگزار شد. در این کارگاه ابتدا مفهوم نگاه شبکه‌ای به سلول و نقش مسیرها و شبکه‌های ژنی در درک بیماری‌ها معرفی شد.
سپس اصول داده‌های بیان ژن با دو فناوری Microarray و RNA-seq و تفاوت کلی آن‌ها توضیح داده شد.
ساختار پایگاه داده NCBI GEO و شناسه‌های GSE، GSM و GPL و روش جست‌وجوی یک دیتاست مناسب برای پژوهش مرور شد.
به‌صورت عملی یک دیتاست میکروآرای (مثلاً Tumor vs Normal) با GEO2R تحلیل و مفهوم DEG، log2FoldChange، p-value و FDR و نمودارهای Volcano/MA معرفی شد.
در پایان، نحوه استفاده از ژن‌های دیفرانسیل برای تفسیر زیستی، تحلیل مسیرها و طراحی پرسش‌های پژوهشی در سرطان و داروسازی جمع‌بندی گردید.